| 【项目名称】 |
贝类基因组的比较与功能基因批量发掘 |
| 【项目编号】 |
2010CB126401 |
| 【项目目标】 |
【研究目标】
1.构建牡蛎全基因组精细图谱：在原有的基因组框架图的基础上进一步构建牡蛎全基因组精细图谱。
2.基因组注释以及重要性状相关基因的规模筛选：确定贝类基因组特征，实现基于GO 和KEGG的基因功能注释与分类；批量筛选出与生长、抗逆和珍珠质形成等重要经济性状相关的候选基因。
3.构建贝类基因组数据库：可在线查询贝类基因组序列、转录组数据、注释基因、SNP及其定位信息、基因家族的基因拷贝数及分布，并提供同源比对等服务功能。
4.知识产权与人才培养：发表SCI论文30篇，其中影响因子>=5.0论文2篇，顶级刊物发表研究论文1篇，专利8个，培养硕士研究生15名、博士研究生10名和博士后3名。
【研究主要内容】
1.牡蛎全基因组序列组装和精细图谱构建：基于已完成的牡蛎全基因组框架图，结合已有的遗传图谱、物理图谱和BAC文库等资源，对基因组序列进一步拼接与组装，构建牡蛎全基因组精细图谱。
2.牡蛎全基因组注释及功能基因的规模开发：借助生物信息学分析软件，对全基因组图谱进行基因组结构分析、基因功能注释与分类，开展转录组研究，丰富已有的EST和cDNA资源，规模开发功能基因。
3.贝类基因组及典型性状相关基因的比较：利用扇贝、珍珠贝的基因组序列，以牡蛎全基因组序列图谱为参考2009-01-21 |
| 【项目关键词】 |
功能基因;基因组数据库;基因组序列;全基因组;性状相关;养殖贝类;设计育种;经济性状;精细图;牡蛎;基因家族;遗传图谱;基因组注释;规模开发;基因组结构;珍珠质;转录组; |
| 【项目承办单位】 |
中国科学院海洋研究所;深圳华大基因研究院 |
| 【项目负责人】 |
张国范;郑洪坤;张素萍;张海滨;王晓通;许飞;蒋智;吴震州 |
| 【项目来源】 |
国家重点基础研究发展计划（973计划）项目 |
| 【涉及学科】 |
水产和渔业 |
| 【科研经费】 |
281.4万 |
| 【所属大项目】 |
养殖贝类重要经济性状的分子解析与设计育种基础研究 |
| 【项目参与研究人员】 |
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| 【项目参与研究机构】 |
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| 【项目成果摘要】 |
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| 【发布单位】 |
科学技术部 |
| 【发布时间】 |
2009-01-21 |
| 【申请截止时间】 |
2009-03-31 |
| 【立项时间】 |
2010-01 |
| 【完成时间】 |
2014-08 |
| 【申请条件】 |
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| 【联系方式】 |
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| 【项目信息来源】 |
http://www.most.gov.cn/tztg/200907/t20090724_71974.htm |